48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1516 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  63.9 
 
 
412 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  61.03 
 
 
360 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  61.21 
 
 
351 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  54.86 
 
 
354 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  49.4 
 
 
353 aa  326  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  27.86 
 
 
365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  27 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  25.24 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  25.07 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  24.73 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  24.2 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  26.04 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  27.42 
 
 
339 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  27.42 
 
 
339 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  30.36 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  27.41 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  30.36 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  24.64 
 
 
362 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  37.36 
 
 
343 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  37.36 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  29.9 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  29.13 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  30.1 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  24.01 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  24.01 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  24.01 
 
 
326 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  24.01 
 
 
356 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  24.01 
 
 
356 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  32.26 
 
 
377 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  24.01 
 
 
356 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  23.53 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  27.74 
 
 
323 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  24.81 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  25.19 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  25.5 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  25.6 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  31.18 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  25.19 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  25.37 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  24.1 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  25.28 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  25 
 
 
333 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  25 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  25.59 
 
 
333 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  25.39 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  25.59 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  31.58 
 
 
333 aa  42.7  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>