76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3537 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  98.8 
 
 		 333 aa  630  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  95.2 
 
 		 333 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  94.89 
 
 		 333 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  93.69 
 
 		 333 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  93.39 
 
 		 333 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  84.68 
 
 		 333 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  84.68 
 
 		 333 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  84.68 
 
 		 333 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  82.93 
 
 		 328 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  84.76 
 
 		 328 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  84.76 
 
 		 328 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  84.76 
 
 		 328 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  94.1 
 
 		 290 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  84.97 
 
 		 286 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  71.6 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  71.12 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  71.9 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  66.06 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  42.59 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  39.06 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  38.12 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  38.75 
 
 		 397 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  37.22 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  39.92 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  33.44 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  37.69 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  37.69 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  39.36 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  33.02 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  34.37 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  34.37 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  35.07 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  34.06 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  34.06 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  34.06 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  34.06 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  34.29 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  34.92 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  32.8 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  30.48 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  32.68 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  31.38 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  28.9 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  27.98 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  30.63 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  31.65 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  37.38 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  32.55 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  31.13 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  31.75 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  30.75 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  34.83 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  30.75 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  30.75 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  36.33 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  35.07 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  34.98 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  30.15 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  31.54 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  31.54 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  31.54 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  31.54 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  31.54 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  31.54 
 
 		 348 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  40.07 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  32.64 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  31.54 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  28.16 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  32.58 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  25.55 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  30.3 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  25.87 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  26.14 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  21.9 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  26.33 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>