80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3018 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  99.16 
 
 
356 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  98.83 
 
 
342 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  99.69 
 
 
326 aa  624  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  98.77 
 
 
326 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  90.75 
 
 
345 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  67.4 
 
 
331 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  68.65 
 
 
331 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  59.01 
 
 
362 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  59.94 
 
 
362 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  60.76 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  38.8 
 
 
333 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  37.69 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  37.7 
 
 
329 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  35.09 
 
 
333 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  35.29 
 
 
333 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  37 
 
 
333 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  37 
 
 
333 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  37 
 
 
328 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  37 
 
 
328 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  35.29 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  36.67 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  36.67 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  36.67 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  35.45 
 
 
338 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  35.45 
 
 
343 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  34.67 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  34.67 
 
 
333 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  38.32 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  35.41 
 
 
339 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  34.09 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  36.17 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  34.06 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  34.88 
 
 
339 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  33.81 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  35.14 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  35.48 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  31.17 
 
 
397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  40.25 
 
 
362 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  30.86 
 
 
377 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  30.22 
 
 
377 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  32.4 
 
 
361 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  35.45 
 
 
290 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  32.01 
 
 
387 aa  123  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  40.64 
 
 
353 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  33.15 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  34.94 
 
 
351 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  29.19 
 
 
370 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  35.16 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  35.16 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  34.73 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  35.16 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  34.52 
 
 
347 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  34.52 
 
 
347 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  34.84 
 
 
343 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  30.19 
 
 
358 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  35.03 
 
 
348 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  35.55 
 
 
349 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  31.68 
 
 
362 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  35.14 
 
 
348 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  31.92 
 
 
335 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  31.27 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  30.17 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  29.77 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  24.32 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  21.84 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  29.21 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  24.78 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  23.78 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  26.1 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  28.5 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  24.35 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>