78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0693 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  99.7 
 
 
333 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  99.7 
 
 
328 aa  627  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  95.12 
 
 
328 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  86.49 
 
 
333 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  99.65 
 
 
286 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  84.98 
 
 
333 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  84.98 
 
 
333 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  84.68 
 
 
333 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  84.98 
 
 
333 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  84.98 
 
 
333 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  83.39 
 
 
290 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  72.21 
 
 
339 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  69.62 
 
 
339 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  70.21 
 
 
329 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  66.06 
 
 
332 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  40.48 
 
 
338 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  38.34 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  38.61 
 
 
377 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  38.17 
 
 
397 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  38.49 
 
 
377 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  34.48 
 
 
333 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  36.53 
 
 
338 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  36.53 
 
 
343 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  37.93 
 
 
361 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  34.62 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  34.88 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  35.07 
 
 
331 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  37.33 
 
 
356 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  37.33 
 
 
326 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  39.18 
 
 
358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  37 
 
 
326 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  37.12 
 
 
342 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  37 
 
 
356 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  37 
 
 
356 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  34.49 
 
 
345 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  34.94 
 
 
329 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  33.54 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  31.65 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  31.91 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  36.12 
 
 
355 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  31.44 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  28.27 
 
 
362 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  38.13 
 
 
353 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  30.46 
 
 
343 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  30.63 
 
 
347 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  32.43 
 
 
349 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  34.32 
 
 
400 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  31.95 
 
 
362 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  30.12 
 
 
349 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  30.72 
 
 
347 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  29.81 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  29.81 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  30.5 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  40.64 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  34.83 
 
 
387 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  35.21 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  32.23 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  31.56 
 
 
348 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  31.56 
 
 
348 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  31.56 
 
 
348 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  31.56 
 
 
348 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  31.56 
 
 
348 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  31.56 
 
 
348 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  29.92 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  29.5 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  25.73 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  32.8 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  35.29 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  20.68 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  24.92 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  25.4 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  25.16 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  28.5 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>