76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3396 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  100 
 
 
333 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  99.7 
 
 
333 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  97.3 
 
 
333 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  96.1 
 
 
333 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  94.89 
 
 
333 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  94.59 
 
 
333 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  84.15 
 
 
328 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  84.98 
 
 
333 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  84.98 
 
 
333 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  84.98 
 
 
333 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  85.06 
 
 
328 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  85.06 
 
 
328 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  85.06 
 
 
328 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  98.57 
 
 
290 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  85.66 
 
 
286 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  73.11 
 
 
339 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  72.81 
 
 
339 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  71.73 
 
 
329 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  66.06 
 
 
332 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  42.01 
 
 
338 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  38.44 
 
 
377 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  38.75 
 
 
377 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  38.44 
 
 
397 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  37.38 
 
 
370 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  39.11 
 
 
358 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  33.54 
 
 
333 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  37.31 
 
 
361 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  37.74 
 
 
338 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  37.74 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  32.81 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  35.42 
 
 
331 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  34.03 
 
 
331 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  33.75 
 
 
326 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  33.75 
 
 
356 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  33.44 
 
 
356 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  33.44 
 
 
356 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  33.44 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  33.44 
 
 
342 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  34.29 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  29.69 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  30.18 
 
 
362 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  31.73 
 
 
333 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  37.12 
 
 
355 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  31.08 
 
 
351 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  38.93 
 
 
353 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  29.7 
 
 
323 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  31.04 
 
 
343 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  35.34 
 
 
400 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  35.34 
 
 
387 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  34.59 
 
 
387 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  34.22 
 
 
348 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  29.94 
 
 
347 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  31.96 
 
 
347 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  30.37 
 
 
349 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  30.35 
 
 
362 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  30.37 
 
 
352 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  30.37 
 
 
352 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  31.33 
 
 
347 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  32.89 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  33.22 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  41.04 
 
 
362 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  32.93 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  30.71 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  29.06 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.95 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  33.23 
 
 
335 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  29.7 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  21.97 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  25.55 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  27.03 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  30.61 
 
 
354 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>