26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2970 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2970  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  656    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.145955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  39.2 
 
 
361 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  39.05 
 
 
1195 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  27.65 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  28.7 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  28.65 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  29.15 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  33.67 
 
 
801 aa  56.2  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  31.29 
 
 
793 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  35.06 
 
 
843 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  30.15 
 
 
247 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04260  hypothetical protein  23.33 
 
 
480 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  32.65 
 
 
773 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  30.91 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  28.72 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  28.01 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0731  hypothetical protein  26.36 
 
 
573 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.84 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  31.48 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  31.94 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  27.43 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  32.3 
 
 
803 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  27.16 
 
 
329 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  37.76 
 
 
795 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  30.15 
 
 
783 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>