109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3426 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  51.16 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  39.55 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  37.3 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  45.67 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  34.38 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  35.2 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  35.83 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  40.48 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  34.17 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  35.34 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  37.04 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.28 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  33.64 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  35.29 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  42.17 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  43.86 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  36.14 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2921  TadE family protein  41.54 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.246386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  48.08 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  36.36 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  36.36 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  32.06 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  36.36 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.88 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  34.51 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  39.06 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  33.67 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  33.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  51.06 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  33.33 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.19 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  45.83 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  55.1 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  45.28 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  25.19 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.68 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.68 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.68 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  32.38 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.92 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  41.82 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  43.55 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  32.89 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  43.55 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  41.67 
 
 		 156 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  44.68 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  32.52 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  45.9 
 
 		 180 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  27 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  32.5 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  31.52 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  33.91 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  30.07 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  36.54 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  38.3 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  34.21 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  42.55 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  29.31 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  41.82 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  27.93 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  31.43 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  40 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  40 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  42.62 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  31.4 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  40 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  42.86 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  36.21 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  34.48 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  31.31 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  44.44 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  37.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  43.4 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  38 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  41.51 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  41.51 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  34.83 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  31.96 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  27.69 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  41.86 
 
 		 204 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  39.22 
 
 		 131 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  33.65 
 
 		 194 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  44.44 
 
 		 722 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  33.33 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  37.5 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  31.48 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  43.14 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  44.07 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2686  hypothetical protein  35.16 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  29.82 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>