114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2921 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2921  TadE family protein  100 
 
 
130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.246386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  48.87 
 
 
129 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  48.03 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  45.52 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.94 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  40.91 
 
 
132 aa  83.6  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  41.98 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  32.81 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.03 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  35.21 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  52 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  38.39 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.48 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  34.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  34.48 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  34.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  34.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  34.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  34.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  34.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  52 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  42.59 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  52.94 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  52.94 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  52.94 
 
 
164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  51.02 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  46.77 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  32.86 
 
 
155 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  31.3 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  40.23 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  31.3 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  29.79 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  43.94 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  32.03 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  36 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.56 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  36.94 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  31.73 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  42.25 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  47.06 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  28.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  28.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  28.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  28.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  28.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  28.47 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  43.48 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  40 
 
 
278 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  25.95 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  40.68 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  36.07 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  40.68 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  34.43 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  34.43 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  34.43 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  28.12 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  41.67 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  34.74 
 
 
209 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  42.03 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  42.03 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  42.03 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  30.28 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  31.82 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  33.05 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  43.84 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4122  TadE family protein  36.52 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  34.55 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  29.13 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  39.66 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  41.67 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  34.38 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  46.15 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  38.46 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  34.38 
 
 
176 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  34.85 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  30.3 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  39.66 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  43.4 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  30.83 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  33.82 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  34.85 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  43.75 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  50 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  42.86 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  33.33 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.58 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  39.58 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  43.75 
 
 
186 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  28.42 
 
 
722 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  38.3 
 
 
166 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  28.57 
 
 
174 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  40.82 
 
 
587 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  35.42 
 
 
143 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  64.44 
 
 
144 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  42.86 
 
 
165 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  42.86 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  31.62 
 
 
130 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0222  TadE family protein  28.21 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  36 
 
 
193 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>