78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1978 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1435    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  33.38 
 
 		 815 aa  360  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  41.13 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  41.43 
 
 		 621 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  37.22 
 
 		 666 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  35.78 
 
 		 515 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  34.42 
 
 		 542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  46.96 
 
 		 278 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  31.36 
 
 		 782 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  33.21 
 
 		 868 aa  127  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  33.21 
 
 		 868 aa  127  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  33.21 
 
 		 868 aa  127  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  39.64 
 
 		 725 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  25.94 
 
 		 496 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  37.26 
 
 		 867 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  40.35 
 
 		 880 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25.68 
 
 		 470 aa  102  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  26 
 
 		 469 aa  101  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  27.37 
 
 		 489 aa  94.4  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  30.54 
 
 		 375 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  24.94 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  25.2 
 
 		 489 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.455218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  25.52 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  23.49 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  30.67 
 
 		 732 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  23.87 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  27.87 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  23.05 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.97 
 
 		 866 aa  75.1  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  43.53 
 
 		 147 aa  71.2  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  27.49 
 
 		 813 aa  68.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  40 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  26.62 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  30.35 
 
 		 895 aa  67.8  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  24.18 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  46.67 
 
 		 738 aa  67.4  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  22.92 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  44.59 
 
 		 127 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  39.62 
 
 		 834 aa  65.1  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  23.08 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1776 aa  63.9  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  25.73 
 
 		 520 aa  63.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  37.3 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  43.48 
 
 		 141 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  35.11 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  43.42 
 
 		 296 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  29.96 
 
 		 684 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  41.89 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  24.03 
 
 		 507 aa  57.4  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  23.19 
 
 		 534 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  24.41 
 
 		 542 aa  56.6  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  21.04 
 
 		 458 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  45.68 
 
 		 759 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  25 
 
 		 848 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  31.3 
 
 		 682 aa  55.8  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  25.91 
 
 		 696 aa  54.7  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  26.57 
 
 		 457 aa  53.5  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  25.44 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.57 
 
 		 731 aa  53.1  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  44.07 
 
 		 798 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  39.76 
 
 		 312 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  28.64 
 
 		 930 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  28.37 
 
 		 350 aa  52.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  44.9 
 
 		 280 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  23.06 
 
 		 501 aa  51.6  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  33.33 
 
 		 765 aa  50.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  33.9 
 
 		 760 aa  50.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  35.85 
 
 		 755 aa  49.3  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  47.69 
 
 		 741 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  24.14 
 
 		 509 aa  48.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  38.24 
 
 		 756 aa  48.1  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  32.64 
 
 		 716 aa  48.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  32.64 
 
 		 712 aa  48.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  39.29 
 
 		 309 aa  47.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  46.94 
 
 		 283 aa  47.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.37 
 
 		 841 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  39.62 
 
 		 293 aa  44.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  36.79 
 
 		 838 aa  44.3  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>