269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2522 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  76.22 
 
 		 143 aa  227  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  64.08 
 
 		 150 aa  201  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  59.31 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  58.62 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  65.52 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  53.9 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  53.19 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  59.31 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  54.93 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  49.66 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  49.32 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  53.1 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  49.35 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  55.56 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  51.01 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  49.32 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  49.02 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  46.26 
 
 		 148 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  47.65 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  46.58 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  46.58 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  60.87 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  48.03 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  56.1 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  61.86 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  55.74 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  48.23 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  61.02 
 
 		 139 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  55.81 
 
 		 137 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  58.26 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  55.81 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2963  large conductance mechanosensitive channel protein  59.65 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  55.2 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  58.26 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  60.17 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  58.12 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  61.74 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  56.67 
 
 		 136 aa  133  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  58.97 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  58.97 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  58.47 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  57.14 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0712  large-conductance mechanosensitive channel  57.02 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  54.89 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  54.89 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  54.89 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  57.26 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  57.26 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  57.26 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  57.26 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  54.14 
 
 		 136 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  53.33 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  53.38 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1187  large conductance mechanosensitive channel protein  55.26 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  47.2 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  54.4 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  58.93 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  46.62 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  56.9 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3333  large-conductance mechanosensitive channel  55.75 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662595  hitchhiker  0.000286923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  51.64 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  54.55 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  56.25 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0929  large-conductance mechanosensitive channel  59.09 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  42.25 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0880  large-conductance mechanosensitive channel  49.61 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0911634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  50.43 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  46.96 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  45.6 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  53.97 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  51.59 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  45.52 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  49.18 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.69 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  50.78 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  50.43 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  53.57 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  55.65 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  51.64 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  50.38 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  47.62 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  44.78 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0340  large-conductance mechanosensitive channel  45.39 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  53.91 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>