More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0084 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 267 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  39.27 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  38.35 
 
 		 281 aa  138  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  38.46 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  38.95 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.95 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  38.95 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4025  LuxR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  33.82 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1634  two component LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0598487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.78 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  44.16 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  47.69 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.67 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.39 
 
 		 894 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.97 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 471 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  42.86 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 454 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 156 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 877 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.88 
 
 		 914 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 235 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.27 
 
 		 228 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 118 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 226 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  27.75 
 
 		 399 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 206 aa  52.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 237 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 427 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4339  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  46.88 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.11 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>