More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3111 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  55.2 
 
 		 229 aa  160  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  60.45 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  61.48 
 
 		 226 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  53.9 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 225 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  51.01 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  59.5 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 225 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  60.16 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  59.38 
 
 		 225 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  59.38 
 
 		 225 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  51.68 
 
 		 227 aa  148  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  59.38 
 
 		 225 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  57.98 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  51.01 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  48.05 
 
 		 233 aa  140  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  52.89 
 
 		 233 aa  140  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  53.28 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  53.12 
 
 		 235 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  53.72 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  54.1 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  54.17 
 
 		 233 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  48.51 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  46.26 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  52.5 
 
 		 206 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  43.59 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  43.59 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  40.38 
 
 		 163 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 227 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  51.67 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  50.83 
 
 		 227 aa  128  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  49.18 
 
 		 229 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  48.36 
 
 		 228 aa  127  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  51.67 
 
 		 229 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  40.24 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  41.84 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  49.17 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  52.29 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  45.53 
 
 		 241 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  45.08 
 
 		 228 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  40.24 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  40.43 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  47.93 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  49.54 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  42.95 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 231 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  40.43 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2505  RadC domain-containing protein  45.45 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0044  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  44.88 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  44.72 
 
 		 229 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0044  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.09 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  44.72 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  42.98 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  46.23 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  46.23 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 225 aa  110  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0170  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  48.04 
 
 		 232 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1619  DNA repair protein RadC  41.3 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  39.52 
 
 		 222 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  39.22 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  49.51 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  44.17 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  40.3 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  40.3 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  37.24 
 
 		 223 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  39.83 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  39.83 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0750  RadC family DNA repair protein  37.41 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  41.41 
 
 		 224 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  42.28 
 
 		 223 aa  100  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  36.92 
 
 		 225 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1216  DNA repair protein  41.41 
 
 		 206 aa  100  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  32.68 
 
 		 222 aa  100  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  37.59 
 
 		 225 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  35.1 
 
 		 243 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  34.96 
 
 		 232 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1181  DNA repair protein RadC  34.9 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.426303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 221 aa  98.2  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2888  DNA repair protein RadC  37.1 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>