More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1619 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1619  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 166 aa  340  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  49.07 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  56.69 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  47.89 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  53.91 
 
 		 222 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  51.97 
 
 		 223 aa  124  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  52.76 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  51.18 
 
 		 223 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  51.18 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1484  DNA repair protein RadC  88.89 
 
 		 77 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  44.44 
 
 		 225 aa  118  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  45.24 
 
 		 222 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  50.94 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  41.3 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  40.71 
 
 		 229 aa  108  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  41.13 
 
 		 228 aa  108  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  41.3 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  41.3 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  38.32 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  44.54 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  45.79 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  37.93 
 
 		 225 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  46.67 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  47.17 
 
 		 233 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  42.96 
 
 		 241 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  47.17 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  41.13 
 
 		 147 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  39.02 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  45.28 
 
 		 231 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  46.23 
 
 		 232 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 		 229 aa  103  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  36.97 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  40.16 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  48.08 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  45.28 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  36.31 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  48.54 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  45.87 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  46.73 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 222 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  44.95 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  45.19 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  38.62 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  39.68 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  44.76 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  47.27 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 246 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  44.86 
 
 		 228 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  48.08 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 233 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  48.08 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 245 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 235 aa  99  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  48.11 
 
 		 229 aa  98.2  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  49 
 
 		 243 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1216  DNA repair protein  40 
 
 		 206 aa  98.2  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 245 aa  97.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 225 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  47 
 
 		 243 aa  97.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  45.83 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1181  DNA repair protein RadC  43.12 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.426303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  37.04 
 
 		 247 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  47.31 
 
 		 247 aa  97.1  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  38.51 
 
 		 257 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  46.81 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  43.41 
 
 		 225 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  40.16 
 
 		 254 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 263 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  43 
 
 		 242 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 231 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 231 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  42.45 
 
 		 232 aa  95.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 227 aa  95.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  39.66 
 
 		 254 aa  94.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  36.81 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  44.55 
 
 		 233 aa  94  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  32.28 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 224 aa  94  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  35.66 
 
 		 246 aa  93.2  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  36.22 
 
 		 226 aa  93.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  40.14 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  44.66 
 
 		 249 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 225 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  39.34 
 
 		 261 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>