More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0067 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  100 
 
 
356 aa  732  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  97.15 
 
 
357 aa  702  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  82.86 
 
 
356 aa  605  1e-172  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  81.46 
 
 
356 aa  603  1e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  85.19 
 
 
356 aa  602  1e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  77.97 
 
 
358 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  78.06 
 
 
356 aa  573  1e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  65.52 
 
 
347 aa  459  1e-128  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  59.14 
 
 
360 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  56.86 
 
 
360 aa  415  1e-115  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  57.75 
 
 
360 aa  417  1e-115  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  57.3 
 
 
360 aa  416  1e-115  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  55.71 
 
 
372 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  55.59 
 
 
369 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  58.88 
 
 
347 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  59.19 
 
 
347 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  57.52 
 
 
344 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  58.88 
 
 
347 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  55.89 
 
 
347 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  58.88 
 
 
347 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  54.91 
 
 
397 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  57.1 
 
 
347 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  56.36 
 
 
347 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  56.97 
 
 
345 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  57.4 
 
 
344 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  56.68 
 
 
345 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  58.57 
 
 
347 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  56.97 
 
 
345 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  56.19 
 
 
347 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  52.82 
 
 
364 aa  378  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  57.23 
 
 
344 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  56.8 
 
 
347 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  57.31 
 
 
349 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  57.94 
 
 
347 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  53.06 
 
 
349 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  57.94 
 
 
347 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  56.08 
 
 
345 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  54.23 
 
 
382 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  56.08 
 
 
345 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  56.68 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  58.26 
 
 
347 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  54.81 
 
 
349 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  56.08 
 
 
345 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  53.94 
 
 
347 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  56.08 
 
 
345 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  6.75214e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  56.68 
 
 
345 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  57.14 
 
 
345 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  53.06 
 
 
349 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76811e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  56.68 
 
 
345 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  56.19 
 
 
347 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  56.08 
 
 
345 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  55.89 
 
 
347 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  56.68 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  56.2 
 
 
356 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  55.79 
 
 
349 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  57.66 
 
 
344 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  55.79 
 
 
345 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  55.39 
 
 
344 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  55.89 
 
 
347 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  57.66 
 
 
344 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  57.88 
 
 
347 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  57.32 
 
 
347 aa  371  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  57.63 
 
 
347 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  56.63 
 
 
345 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  54.68 
 
 
347 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  55.26 
 
 
345 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  56.39 
 
 
347 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  54.36 
 
 
350 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  54.98 
 
 
344 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  54.98 
 
 
344 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  56.93 
 
 
345 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  53.94 
 
 
350 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  54.81 
 
 
344 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  53.64 
 
 
344 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  55.26 
 
 
344 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  53.94 
 
 
430 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  55.26 
 
 
344 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  55.26 
 
 
344 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  53.43 
 
 
566 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  56.53 
 
 
346 aa  362  5e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  54.22 
 
 
344 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  53.1 
 
 
345 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  54.22 
 
 
344 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.69 
 
 
351 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.75789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  53.64 
 
 
344 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  50.86 
 
 
364 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  55.28 
 
 
345 aa  357  2e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  51.74 
 
 
345 aa  356  3e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.58 
 
 
372 aa  355  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  56.02 
 
 
378 aa  355  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  55.02 
 
 
346 aa  355  7e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  54.93 
 
 
344 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  54.71 
 
 
346 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  56.72 
 
 
374 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  53.03 
 
 
362 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  55.9 
 
 
344 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  55.79 
 
 
374 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  54.01 
 
 
345 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  54.9 
 
 
372 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  51.45 
 
 
349 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>