More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6336 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 		 365 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  28.62 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  26.19 
 
 		 362 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.22 
 
 		 493 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  37.17 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  20.83 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  32.07 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  32.86 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  35.78 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 416 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  45.56 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 		 1033 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 184 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  44.66 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  40.57 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  47.78 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  46.74 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.33 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  42.28 
 
 		 973 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  36.8 
 
 		 900 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  34.36 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  44.57 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.74 
 
 		 521 aa  62.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  45.36 
 
 		 115 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  39 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  38.13 
 
 		 776 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  51.39 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  48.81 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  44.21 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 		 903 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4134  pentapeptide repeat protein  44.3 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.159468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  26.97 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  38.3 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  39.33 
 
 		 706 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  40.66 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.41 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  32.38 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  51.52 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  37.72 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  37.23 
 
 		 830 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  46.07 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.58 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  44.87 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  47.13 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  39.05 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  33.08 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  43.37 
 
 		 122 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  40.86 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  33.08 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  36.15 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  47.5 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.23 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  38.24 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  40.4 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  45.98 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  45 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.83 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.96 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 447 aa  55.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.2 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.05 
 
 		 600 aa  55.8  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  39.78 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  36.46 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  53.12 
 
 		 172 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  37.39 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.69 
 
 		 525 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>