174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0636 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0636  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 830 aa  1552    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00254265  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 		 769 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  32.28 
 
 		 753 aa  164  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  32.64 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  30.5 
 
 		 803 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  29.75 
 
 		 790 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  28.21 
 
 		 788 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  25.41 
 
 		 859 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 		 825 aa  98.2  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  30.41 
 
 		 762 aa  96.3  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  28.53 
 
 		 754 aa  94.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  24.87 
 
 		 866 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  37.21 
 
 		 815 aa  91.3  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  33.6 
 
 		 827 aa  90.9  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  29.2 
 
 		 725 aa  90.9  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  29.41 
 
 		 850 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  28.61 
 
 		 812 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  29.39 
 
 		 800 aa  88.2  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 		 782 aa  88.2  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  32.6 
 
 		 810 aa  87.8  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  41.3 
 
 		 790 aa  84  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 		 720 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  28.03 
 
 		 749 aa  81.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  31.11 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  26.2 
 
 		 890 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  28.61 
 
 		 808 aa  80.5  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  24.22 
 
 		 728 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  34.39 
 
 		 677 aa  79  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  32.63 
 
 		 771 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 		 763 aa  78.2  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  32.43 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  22.31 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 		 792 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  37.32 
 
 		 790 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  26.81 
 
 		 744 aa  75.1  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  29.7 
 
 		 736 aa  74.7  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  27.55 
 
 		 788 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  26.4 
 
 		 837 aa  73.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  33.19 
 
 		 743 aa  73.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  30.1 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  29.78 
 
 		 774 aa  72.8  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 		 886 aa  71.2  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  26.07 
 
 		 831 aa  70.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  31.06 
 
 		 681 aa  70.5  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 		 840 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  29.23 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  26.56 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  19.22 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  19.22 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  25.7 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  25.64 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  29.24 
 
 		 790 aa  67.4  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  27.44 
 
 		 762 aa  67  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.43 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0726  transglutaminase domain protein  33.51 
 
 		 668 aa  67.4  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  24.56 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3624  hypothetical protein  27.56 
 
 		 671 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.67941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  40.78 
 
 		 706 aa  66.6  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  25.7 
 
 		 742 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  31.98 
 
 		 862 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  28.97 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  25.12 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  38.32 
 
 		 676 aa  64.7  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  28.53 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  29.84 
 
 		 681 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3572  transglutaminase domain protein  30.99 
 
 		 982 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  34.31 
 
 		 673 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 674 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.56 
 
 		 783 aa  62.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 674 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  26.21 
 
 		 767 aa  62.8  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  29.53 
 
 		 859 aa  62.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  27.85 
 
 		 742 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  26.44 
 
 		 742 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  26.44 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  31.06 
 
 		 794 aa  61.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 		 800 aa  61.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  32.58 
 
 		 760 aa  60.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0251  transglutaminase-like protein  26.05 
 
 		 851 aa  60.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0634947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  24.56 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2816  transglutaminase domain-containing protein  33.51 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107487  normal  0.263769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  36.55 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  23.21 
 
 		 683 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  26.63 
 
 		 767 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  24.9 
 
 		 715 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  23.83 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  25.81 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  25 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  33.08 
 
 		 667 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  32.82 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2305  transglutaminase domain protein  32.99 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  26.84 
 
 		 818 aa  57.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  32.23 
 
 		 1238 aa  57.4  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2519  transglutaminase-like  37.89 
 
 		 645 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  33.93 
 
 		 770 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  37.96 
 
 		 943 aa  57  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3011  transglutaminase domain protein  43.9 
 
 		 672 aa  57.4  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.340664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  30.51 
 
 		 790 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>