More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0144 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 378 aa  776    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  62.1 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.1 
 
 		 599 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.58 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.24 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  42.42 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  42.08 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  44.27 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  41.6 
 
 		 457 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.36 
 
 		 441 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  42.67 
 
 		 440 aa  291  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  43.34 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  41.32 
 
 		 429 aa  288  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  40.15 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  40.95 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  42.64 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  41.12 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  41.1 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  42.42 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  40.6 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  42.53 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  41.82 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  41.56 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  40.47 
 
 		 425 aa  281  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  43.32 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  40.98 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  41.69 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  39.45 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  44.33 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  38.93 
 
 		 423 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  41.18 
 
 		 435 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  39.55 
 
 		 446 aa  278  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  41.22 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  42.01 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  42.01 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  42.01 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 435 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  40.83 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  44.29 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  41.03 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  41.03 
 
 		 446 aa  272  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  41.97 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  41.54 
 
 		 439 aa  272  7e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  43.43 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  39.12 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  42.25 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  40.71 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  41.42 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  39.48 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  38.44 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  39.38 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  39.64 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  42.42 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  38.27 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  41.71 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1998  recombination factor protein RarA  40.58 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.805499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  41.27 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  39.59 
 
 		 444 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  40.11 
 
 		 442 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  41.32 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  39.47 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  40.91 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 442 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  42.56 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  38.01 
 
 		 435 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  38.7 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  38.66 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  41.6 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0758  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000599835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  40.62 
 
 		 440 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1168  recombination factor protein RarA  39.69 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  38.83 
 
 		 463 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  39.85 
 
 		 457 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  41.11 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  40.53 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0339  recombination factor protein RarA  39.69 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 447 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  41.76 
 
 		 437 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 457 aa  263  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  36.83 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  43.13 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  37.63 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  40.86 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  40.86 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  39.64 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  41.99 
 
 		 437 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  38.46 
 
 		 459 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  37.63 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  41.48 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  38.14 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  40.8 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  40.72 
 
 		 438 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  38.92 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  39.74 
 
 		 444 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  38.83 
 
 		 444 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0066  AAA ATPase central domain protein  40.44 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>