More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1323 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 411 aa  835    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  43.69 
 
 		 599 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  43.2 
 
 		 599 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  39.48 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  41.3 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  39.04 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  41.06 
 
 		 434 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 442 aa  289  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 447 aa  289  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  43.23 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  39.72 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  39.81 
 
 		 442 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  38.88 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  38.57 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  40.61 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 432 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  39.1 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  40.59 
 
 		 447 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  40.14 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  40.78 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  36.24 
 
 		 463 aa  280  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  39.24 
 
 		 440 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 		 426 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  40.53 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  39.39 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  39.01 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  39.71 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 		 440 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  38.95 
 
 		 447 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  38.46 
 
 		 440 aa  276  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  39.27 
 
 		 442 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  40.29 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  38.86 
 
 		 435 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 		 437 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  40.61 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  39.95 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  40 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  38.16 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  38.65 
 
 		 436 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  38.12 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  38.89 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  38.44 
 
 		 425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  36.85 
 
 		 457 aa  273  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  37.93 
 
 		 397 aa  273  6e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  38.88 
 
 		 443 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  38.57 
 
 		 441 aa  272  9e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  39.29 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  38.95 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  38.33 
 
 		 404 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  38.72 
 
 		 436 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  38.72 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  37.14 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2357  recombination factor protein RarA  38.77 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.545615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  38.95 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0748  recombination factor protein RarA  38.15 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  38.76 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  37.91 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.95 
 
 		 731 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  35.46 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  38.64 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  38.94 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  38.48 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  37.53 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  39.66 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  41.43 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1516  AAA ATPase central domain protein  39.13 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  38.44 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  37.92 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  38.44 
 
 		 437 aa  265  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  36.38 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  39.81 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2421  recombination factor protein RarA  37.8 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.234269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.32 
 
 		 734 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  37.5 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.53 
 
 		 734 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  37.26 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  39.45 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0103  recombination factor protein RarA  38.11 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  38.2 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  38.57 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  38.17 
 
 		 439 aa  262  6.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  38.28 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  37.68 
 
 		 436 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>