223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2285 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  100 
 
 
386 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 
390 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
388 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
386 aa  276  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
387 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  36.49 
 
 
405 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  35.45 
 
 
432 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 
387 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
381 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
408 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
383 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  27.12 
 
 
398 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
369 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  31.09 
 
 
401 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
398 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
392 aa  157  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  26.52 
 
 
441 aa  156  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  26.67 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
391 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.77 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
379 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
407 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  30.14 
 
 
384 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  30.14 
 
 
384 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  30.14 
 
 
384 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
402 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 
391 aa  150  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  27.86 
 
 
378 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  27.86 
 
 
378 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  27.86 
 
 
378 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  27.86 
 
 
378 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  27.86 
 
 
378 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  31.02 
 
 
377 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  24.66 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  27.58 
 
 
378 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  26.56 
 
 
447 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  24.93 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  25.55 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  27.58 
 
 
378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
379 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
387 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.17 
 
 
384 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  27.01 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  30.94 
 
 
377 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  26.46 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  25.77 
 
 
383 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
389 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
386 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  29.89 
 
 
400 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  27.2 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  26.2 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  25.92 
 
 
385 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  25.92 
 
 
385 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  24.21 
 
 
396 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
400 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  28.49 
 
 
384 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  25.34 
 
 
408 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  29.04 
 
 
382 aa  135  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  29.13 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  25.98 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
405 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  27.27 
 
 
403 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  27.07 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.27 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.3 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  27.57 
 
 
411 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  28.61 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  27.27 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  25.65 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  26.42 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  27.82 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  28.12 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  25.27 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
433 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  26.36 
 
 
393 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.49 
 
 
391 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  27.25 
 
 
379 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  27.67 
 
 
391 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  25.9 
 
 
388 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  24.14 
 
 
400 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  25.06 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  24.53 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  26.79 
 
 
399 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  26.79 
 
 
399 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  26.79 
 
 
399 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
373 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  24.5 
 
 
428 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>