117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0700 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  63.32 
 
 		 203 aa  246  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  60.61 
 
 		 198 aa  233  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  49.01 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  50.26 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  51.6 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  38.81 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  43.67 
 
 		 261 aa  141  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  40.64 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  27.98 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  27.04 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  34.82 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  25.13 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  28.95 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  25 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.03 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  25.4 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  30.51 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  25.13 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.73 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  27.97 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  28.57 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  27.89 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  28.45 
 
 		 357 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  30.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  27.87 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  27.08 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  26.2 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  29.35 
 
 		 164 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  29.35 
 
 		 164 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  29.46 
 
 		 358 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  29.36 
 
 		 166 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  28.12 
 
 		 167 aa  48.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  25.86 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  26.34 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  30.48 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  28.7 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  30.89 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  30.17 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  30.17 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  30.17 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  30.17 
 
 		 171 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  30.63 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  26.49 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  24.79 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  26.5 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  28.8 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  23.89 
 
 		 358 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  26.05 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  25.86 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  26.96 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  26.47 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  25.64 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  25.64 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1093  lipoprotein signal peptidase  33.62 
 
 		 153 aa  45.1  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  27.83 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  25.64 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  32.73 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  26.96 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  27.73 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  28.26 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  30.48 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  26.96 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  27.43 
 
 		 364 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  26.63 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  35.34 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  29.52 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  31.09 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  28.26 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  28.26 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.84 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  27.52 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  28.04 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  29.52 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  29.52 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>