72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0780 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  41.18 
 
 
214 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  37.86 
 
 
251 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  48.95 
 
 
204 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  45.77 
 
 
144 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  31.22 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  36.64 
 
 
234 aa  73.6  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  2.67835e-09  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.87 
 
 
265 aa  72  8e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  34.06 
 
 
230 aa  70.5  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  33.75 
 
 
289 aa  69.7  4e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  1.31906e-10  hitchhiker  7.54842e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  32.39 
 
 
280 aa  68.9  6e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  27.64 
 
 
230 aa  68.2  1e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  28.64 
 
 
235 aa  67.4  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  25.13 
 
 
204 aa  66.6  3e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  36.36 
 
 
289 aa  65.5  8e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  8.55833e-07  hitchhiker  5.27672e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  36.36 
 
 
289 aa  65.5  8e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  5.44418e-07 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  32.92 
 
 
219 aa  61.6  1e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  25.52 
 
 
233 aa  61.6  1e-08  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  4.08495e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.77 
 
 
273 aa  59.7  4e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  31.76 
 
 
283 aa  58.5  8e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  31.65 
 
 
213 aa  58.5  8e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  25.32 
 
 
238 aa  58.2  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.99055e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25.32 
 
 
238 aa  58.2  1e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.4182e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  32.65 
 
 
209 aa  56.6  3e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  27.03 
 
 
247 aa  56.2  5e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.02138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 
210 aa  55.8  6e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.86 
 
 
227 aa  55.1  9e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  31.82 
 
 
247 aa  54.7  1e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  32.65 
 
 
216 aa  54.3  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  29.84 
 
 
283 aa  53.9  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  22.92 
 
 
240 aa  53.9  2e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  29.5 
 
 
206 aa  53.9  2e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  26 
 
 
225 aa  53.9  2e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  30.34 
 
 
193 aa  53.1  3e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  28.8 
 
 
224 aa  52.8  5e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  3.41462e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  26.5 
 
 
239 aa  52.8  5e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.33 
 
 
222 aa  52  9e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.87 
 
 
215 aa  51.2  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  26.98 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.11 
 
 
264 aa  50.4  2e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  21.94 
 
 
240 aa  50.8  2e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  29.35 
 
 
284 aa  50.8  2e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.37 
 
 
264 aa  50.1  3e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  26.37 
 
 
302 aa  50.1  3e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.54 
 
 
248 aa  49.7  5e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  2.11881e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  24.37 
 
 
243 aa  48.9  8e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.59 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  32.54 
 
 
233 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.16 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  24.16 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  28.28 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  35.05 
 
 
239 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  32.28 
 
 
210 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23 
 
 
205 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  23.79 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  23.3 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  32.61 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  21.21 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  30.17 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  26.95 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  1.60936e-08 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  29.77 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  25.13 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  29.85 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.2 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  28.98 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  27.47 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  29.58 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  33.33 
 
 
142 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.7 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.62 
 
 
248 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  26.37 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  26.7 
 
 
229 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.8003e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>