More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3344 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  83.82 
 
 		 311 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  67.31 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  68.75 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  68.42 
 
 		 313 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  65.45 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  59.09 
 
 		 319 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  51.61 
 
 		 325 aa  322  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  54.07 
 
 		 316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  48.85 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  45.78 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  46.58 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  49.31 
 
 		 287 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  48.64 
 
 		 288 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  47.32 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  46.44 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  48.14 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  42.58 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  46 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  41.95 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  31.79 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  31.99 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.06 
 
 		 605 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  31.43 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  29.63 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  28.96 
 
 		 800 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  31.25 
 
 		 629 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  27.95 
 
 		 819 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  29.37 
 
 		 804 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  27.99 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  30.03 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  27.16 
 
 		 1224 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 		 806 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  28.43 
 
 		 804 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.23 
 
 		 816 aa  90.9  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  32.91 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  29.63 
 
 		 801 aa  90.1  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  32.19 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  30.92 
 
 		 813 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  31.08 
 
 		 841 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  28.76 
 
 		 801 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  28.39 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  28.85 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.6 
 
 		 807 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.68 
 
 		 609 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  32.4 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  30.77 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  23.34 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  24.92 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.12 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  32.09 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.68 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  30.7 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  28.92 
 
 		 1236 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  30.6 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.13 
 
 		 610 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  30.2 
 
 		 811 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  30.38 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  30.25 
 
 		 1169 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.78 
 
 		 610 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.82 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  30.13 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  27.56 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0843  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.47 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.43 
 
 		 605 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  27.91 
 
 		 804 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  27.05 
 
 		 1227 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  29.52 
 
 		 1212 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  27.61 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  25.7 
 
 		 1225 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  27.61 
 
 		 1266 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  27.24 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  26.33 
 
 		 1249 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  27.76 
 
 		 804 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  26.79 
 
 		 1271 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  26.82 
 
 		 768 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  26.82 
 
 		 768 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  25.08 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  25.91 
 
 		 1228 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  26.54 
 
 		 1208 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  25.47 
 
 		 1250 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  25.24 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  25.82 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  31.09 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  25.33 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  27.3 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  25.53 
 
 		 1240 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  27.22 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.16 
 
 		 1208 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  29.15 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  24.85 
 
 		 1232 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  27.58 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  26.91 
 
 		 1250 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  26.91 
 
 		 1250 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  26.33 
 
 		 1247 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  25.61 
 
 		 1220 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  26.85 
 
 		 1232 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  24.92 
 
 		 1239 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  28.75 
 
 		 1171 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  25.08 
 
 		 1238 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>