More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0562 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  93.23 
 
 		 517 aa  944    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 517 aa  1022    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  51.75 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  42.67 
 
 		 538 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  42.48 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  42.86 
 
 		 536 aa  445  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  41.78 
 
 		 531 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  41.9 
 
 		 537 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  41.89 
 
 		 538 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  41.9 
 
 		 537 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  41.29 
 
 		 540 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.29 
 
 		 537 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  41.59 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  41.37 
 
 		 536 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  40.95 
 
 		 532 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  41.52 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  41.14 
 
 		 535 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  41.29 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 537 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  41.71 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  41.14 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  41.33 
 
 		 533 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 572 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  41.71 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  41.71 
 
 		 560 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  42.1 
 
 		 536 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  41.9 
 
 		 544 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  40.57 
 
 		 538 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  44.69 
 
 		 506 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  41.33 
 
 		 545 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  41.34 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  43.31 
 
 		 523 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  41.9 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  42.65 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  42.04 
 
 		 548 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  42.53 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  43.8 
 
 		 538 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  42.41 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  42 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  42 
 
 		 535 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  39.63 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  37.54 
 
 		 590 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  42.45 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  38.98 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  39.45 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  37.86 
 
 		 497 aa  345  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  38.14 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  37.99 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  37.99 
 
 		 503 aa  333  6e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2816  transcription elongation factor NusA  36.91 
 
 		 503 aa  329  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2133  NusA antitermination factor  36.47 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.502906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  37.28 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 492 aa  327  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  35.36 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01302  transcription elongation factor NusA  37.11 
 
 		 495 aa  326  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.30262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  34.85 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  34.05 
 
 		 506 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  35.69 
 
 		 494 aa  323  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2747  NusA antitermination factor  36.08 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  36.21 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  36.58 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  37.78 
 
 		 493 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  35.86 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  35.86 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  34.31 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000562867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  35.29 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  35.6 
 
 		 499 aa  317  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3061  transcription elongation factor NusA  36.95 
 
 		 499 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000291489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  35.49 
 
 		 506 aa  317  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  35.29 
 
 		 499 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1090  transcription elongation factor NusA  35.29 
 
 		 499 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136267  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  36.57 
 
 		 501 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  35.69 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  34.71 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  35.73 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  35.73 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0989  transcription elongation factor NusA  35.23 
 
 		 499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0722775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  34.51 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1203  transcription elongation factor NusA  34.87 
 
 		 499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  36.57 
 
 		 491 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  35.71 
 
 		 499 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  36.06 
 
 		 493 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  33.86 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2835  transcription elongation factor NusA  35.08 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3240  transcription elongation factor NusA  35.5 
 
 		 499 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.001866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  35.82 
 
 		 491 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3281  transcription elongation factor NusA  35.5 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3418  transcription elongation factor NusA  35.5 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  hitchhiker  0.000891299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1127  transcription elongation factor NusA  35.5 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000246453  unclonable  0.00000000000839394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  35.44 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  35.36 
 
 		 503 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2821  transcription elongation factor NusA  35.62 
 
 		 492 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  34.36 
 
 		 498 aa  309  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  34.65 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  33.66 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  35.53 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  35.53 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  34.65 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  33.53 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>