96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3045 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  100 
 
 		 335 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  69.79 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  29.11 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  31.51 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1831  hypothetical protein  23.7 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  26.42 
 
 		 370 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  29.61 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  24.17 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.07 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  29.69 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  31.25 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3432  hypothetical protein  26.27 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  27.21 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  29 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  24.18 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  25.22 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  25.96 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.32 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  29.34 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  29.69 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.78 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  25.89 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  25.47 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  27.65 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  24.86 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  24.37 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  23.72 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2852  hypothetical protein  24.04 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000023268 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  27.59 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  29.34 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  28.29 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  21.78 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  26.92 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  29.06 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  24.51 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  29.02 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  25.7 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3173  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  26.1 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  30.88 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  23.49 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.94 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  26.6 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  27.51 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  28.19 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  23.83 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  26.7 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  26.21 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0767  hypothetical protein  23.2 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0468  hypothetical protein  28.18 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  22.83 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  25.6 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  23.48 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  28.48 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  30.17 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  28.57 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.63 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  31.33 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  29.71 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.2 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  21.57 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  25.15 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  23.2 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  23.91 
 
 		 373 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  25.44 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1327  hypothetical protein  26.18 
 
 		 347 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0362501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  20.62 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  27.54 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  26.43 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  26.1 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  30.51 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1059  hypothetical protein  28.71 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0735999  normal  0.223268 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2500  hypothetical protein  19.82 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.74 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2396  hypothetical protein  28.43 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2484  methicillin resistance protein  29.25 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  25.31 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  25 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2436  methicillin resistance protein  29.25 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  22.46 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  23.15 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1880  hypothetical protein  25.67 
 
 		 309 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  22.51 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  28.32 
 
 		 360 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  26.75 
 
 		 753 aa  46.2  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  24.84 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  21.43 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  20.1 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2313  protein of unknown function DUF482  27.72 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  35.59 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  27.93 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  23.1 
 
 		 471 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0114  hypothetical protein  25.6 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  31.43 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  31.43 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>