More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1639 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  70.4 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  63.68 
 
 		 229 aa  286  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  57.01 
 
 		 243 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  52.25 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  52.25 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  45.13 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  44.59 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  46.19 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  41.23 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.1 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.11 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  40.27 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  40.27 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  45.7 
 
 		 377 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  43.59 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  40.27 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  41.52 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.3 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.05 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  40.89 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  41.71 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.62 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  44.7 
 
 		 383 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  41.71 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  44.7 
 
 		 383 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  39.72 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  43.69 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  44.24 
 
 		 385 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  39.21 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  45.5 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  41.81 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.72 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.8 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  42.48 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  42.48 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.72 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  45.5 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  45.41 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  41.12 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  43.11 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  37.72 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  45.28 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  44.93 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  44.93 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  40.09 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  41.44 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  40.18 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  44.44 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.54 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  42.13 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  41.59 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  36 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.74 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  45.24 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  39.66 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2312  ribonuclease III  44 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.842494  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  41.48 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2929  ribonuclease III  38.43 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  43 
 
 		 234 aa  157  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  41.92 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  41.18 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0598  ribonuclease III  44.14 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  41.63 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  45.36 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  40.09 
 
 		 273 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  43.89 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  42.04 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  43.89 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  36 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.16 
 
 		 243 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.16 
 
 		 243 aa  154  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1094  ribonuclease III  47.72 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000355243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  42.34 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  39.29 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  38.86 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  38.43 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03536  ribonuclease III  40.53 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1245  ribonuclease III  37.99 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  39.91 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  39.56 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2930  ribonuclease III  37.99 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0449056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002497  ribonuclease III  40.09 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.186598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2848  ribonuclease III  37.99 
 
 		 226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0494386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1278  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.251882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1201  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00370758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3112  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000174676  hitchhiker  0.00647326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3026  ribonuclease III  37.55 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  39.42 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1444  ribonuclease III  43.17 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  40.27 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  36.68 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  39.38 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>