More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0822 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  69.02 
 
 		 613 aa  896    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.03 
 
 		 598 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  52.42 
 
 		 629 aa  638    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 614 aa  681    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  54.08 
 
 		 630 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 		 608 aa  677    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  82.75 
 
 		 613 aa  1025    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  71.48 
 
 		 619 aa  905    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  55.52 
 
 		 615 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 		 650 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 603 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 605 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  54.36 
 
 		 595 aa  638    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  80.07 
 
 		 608 aa  1003    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.24 
 
 		 606 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 602 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  52.24 
 
 		 630 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 		 600 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  75.08 
 
 		 614 aa  956    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  54.25 
 
 		 608 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  68.67 
 
 		 634 aa  853    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  52.64 
 
 		 592 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  55.68 
 
 		 615 aa  680    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 		 620 aa  659    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 605 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  49.59 
 
 		 604 aa  639    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  58.03 
 
 		 608 aa  729    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 612 aa  1248    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  58.28 
 
 		 605 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 		 610 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 		 610 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  57.26 
 
 		 594 aa  677    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  52.46 
 
 		 617 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 610 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 632 aa  646    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  54.66 
 
 		 617 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  57.02 
 
 		 594 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 		 616 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 		 616 aa  680    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.94 
 
 		 601 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  55.52 
 
 		 615 aa  679    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  54.62 
 
 		 617 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  54.2 
 
 		 613 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 610 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  52.44 
 
 		 599 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 620 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  52.61 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  52.61 
 
 		 608 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  50.73 
 
 		 641 aa  628  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 598 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  52.83 
 
 		 614 aa  629  1e-179  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  53.27 
 
 		 607 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 		 620 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 		 601 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 622 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  51.66 
 
 		 605 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  54.1 
 
 		 593 aa  627  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  51.83 
 
 		 609 aa  625  1e-177  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 602 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  52.5 
 
 		 614 aa  624  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0174  GTP-binding protein TypA  53.18 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.834705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  52.38 
 
 		 614 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 606 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 602 aa  622  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 		 606 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  52.3 
 
 		 606 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.52 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  50.58 
 
 		 606 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 605 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 610 aa  620  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  51.98 
 
 		 624 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.5 
 
 		 602 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  51.65 
 
 		 621 aa  621  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 602 aa  621  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  51.41 
 
 		 607 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 608 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  51.74 
 
 		 608 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  50.99 
 
 		 605 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 608 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3029  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 		 605 aa  617  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 608 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 606 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 603 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 608 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.51 
 
 		 603 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 		 605 aa  617  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  50.58 
 
 		 602 aa  618  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 608 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 610 aa  618  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 602 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  48.6 
 
 		 612 aa  615  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>