51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2960 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  100 
 
 		 517 aa  994    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  99.03 
 
 		 517 aa  986    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  54.73 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  55.31 
 
 		 582 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  44.47 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  43.76 
 
 		 503 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  42.74 
 
 		 565 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  45.49 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  33.11 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  36.7 
 
 		 605 aa  94.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  29.51 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  27.69 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 607 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  23.12 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  25.7 
 
 		 595 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  23.44 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.02 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  23.98 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 578 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 594 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  35.44 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  35.44 
 
 		 418 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  26.46 
 
 		 595 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 930 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.59 
 
 		 594 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  32.67 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  27.78 
 
 		 661 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 754 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 512 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  28.99 
 
 		 544 aa  47.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  28.42 
 
 		 595 aa  47.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  24.36 
 
 		 594 aa  47.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  28.37 
 
 		 595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  28.37 
 
 		 595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  28.37 
 
 		 595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  28.37 
 
 		 595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  35.37 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  26.74 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  31.1 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  35.29 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  28.03 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 592 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  33.61 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 592 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 592 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 415 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  28.99 
 
 		 438 aa  43.9  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>