More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4004 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 181 aa  351  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 218 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 218 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.95 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 105 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 106 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3681  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  30.59 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 118 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8637  putative transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 118 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 71 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 106 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 117 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  24.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 277 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 71 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  26.95 
 
 		 255 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 71 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 106 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  33.85 
 
 		 245 aa  52  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 69 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 69 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 69 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 128 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  36.51 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0551  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 106 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  43.64 
 
 		 107 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 140 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1419  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  39.47 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  43.64 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  43.64 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 72 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2836  DNA-binding protein  39.39 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000716748  hitchhiker  0.00000000374058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 68 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1035  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000017846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>