More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0758 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  37.65 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  37.2 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  37.2 
 
 		 147 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  35.48 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.54 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.06 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.03 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.81 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.19 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.7 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.67 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.67 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  30.43 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36.31 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.25 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  37.09 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.82 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.61 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.74 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.95 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.83 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.01 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  32.9 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.83 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  33.33 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  33.12 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.22 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.12 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  55 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  32.28 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30.82 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  53.45 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  32.72 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  57.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  57.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.39 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  57.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  57.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  31.85 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  57.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  57.41 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.48 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  55 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  55 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  60.38 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  32.3 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  38.89 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.21 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  32.91 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.18 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  32.05 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  29.27 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  31.21 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.25 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.72 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.34 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  32.48 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  33.54 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  30.95 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  46.15 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.57 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  31.9 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  53.7 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.34 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.86 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.13 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.72 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  53.7 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  55.81 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  54.72 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.14 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  53.7 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  53.7 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  28.12 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.33 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  55.81 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  42.67 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  53.7 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>