More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0058 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  55.81 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  49.61 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  50.78 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  50.78 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  50.78 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  50.78 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  51.56 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  50.72 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  50.78 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  49.22 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  46.15 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  46.51 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  50 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  44.96 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  49.23 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  48.85 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  43.07 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  43.08 
 
 		 152 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  46.03 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  41.09 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  35.51 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 279 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.33 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.83 
 
 		 216 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.94 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.11 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  36.23 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.09 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.56 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.94 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.33 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  34.13 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  32.45 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  35.07 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  29.55 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  33.56 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  55.56 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.06 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  31.39 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  31.39 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.03 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  32.37 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 845 aa  61.6  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.91 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  28.24 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 252 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.38 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.77 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.38 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  27.82 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.37 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.16 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  32.31 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.4 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  28 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  27.34 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32.35 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.69 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 431 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 385 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.98 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  34.68 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.33 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 380 aa  57  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  30.2 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.09 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.42 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>