More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2900 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2900  rhomboid family protein  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.28632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0326  Rhomboid family protein  59.53 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  52.97 
 
 		 220 aa  217  8.999999999999998e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1165  rhomboid family protein  49.3 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00020927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  51.6 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  50 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  47.27 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  50.23 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0953  Rhomboid family protein  49.53 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00030487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  44.16 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  49.07 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  44.4 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  43.24 
 
 		 230 aa  178  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  43.78 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  43.81 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  45 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  43.56 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  47.14 
 
 		 284 aa  175  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  46.9 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  44.89 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1446  rhomboid family protein  41.7 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.154997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  44.09 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  44.34 
 
 		 252 aa  167  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0331  rhomboid family protein  44.49 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  42.08 
 
 		 246 aa  165  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0999  Rhomboid family protein  44.89 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.46711  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0913  Rhomboid family protein  42.53 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0106896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  41.63 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  42.01 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2713  Rhomboid family protein  41.71 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  42.04 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  40.34 
 
 		 247 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  41.33 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  44.44 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  42.92 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  40.99 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  48.82 
 
 		 258 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1502  rhomboid family protein  42.41 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.175521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2616  rhomboid family protein  37.71 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  41.4 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0686  rhomboid family protein  42.34 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0078809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  39.37 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2204  rhomboid-like protein  42.79 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  40.81 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  40.65 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  39.32 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1012  Rhomboid family protein  42.62 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555953  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0199  rhomboid family protein  40.72 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0957331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  47.88 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1015  Rhomboid family protein  42.19 
 
 		 246 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  40.95 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1696  rhomboid-like protein  45.97 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0169703  normal  0.97401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0954  rhomboid-like protein  41.77 
 
 		 246 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.762846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0884  rhomboid family protein  41.26 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  53.42 
 
 		 298 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  39.75 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1249  rhomboid family protein  38.91 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  47.39 
 
 		 246 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  41.96 
 
 		 245 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2337  rhomboid family protein  41.75 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1216  rhomboid family protein  39.64 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0742  Rhomboid family protein  47.1 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  42.61 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0892  Rhomboid family protein  42.72 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.736144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1635  rhomboid family protein  39.56 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0916  rhomboid-like protein  35.91 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  43.32 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4977  rhomboid family protein  52.32 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  36.64 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0839  rhomboid family protein  46.92 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2167  hypothetical protein  46.45 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  40.27 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0405  Rhomboid family protein  42.13 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  36 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  35.81 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0605  hypothetical protein  53.1 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00675072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  37.14 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1551  rhomboid-like protein  35.94 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  34.43 
 
 		 360 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  34.43 
 
 		 360 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1953  Rhomboid family protein  36.84 
 
 		 267 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  34.96 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  36.41 
 
 		 360 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0239  rhomboid family protein  36.53 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.270318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03550  peptidase, S54 (rhomboid) family  41.5 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  34.62 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3140  Rhomboid family protein  35.47 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0305  Rhomboid family protein  38.36 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000904763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  37.44 
 
 		 444 aa  97.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1026  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877096  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0329  rhomboid family protein  39.1 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0365  hypothetical protein  40.82 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1218  rhomboid family protein  35.23 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1937  rhomboid family protein  32.72 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1256  rhomboid family protein  34.66 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2016  rhomboid-like protein  36.11 
 
 		 504 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0702  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  34.34 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  33.01 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0559  S54 family peptidase  29.09 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>