More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2980 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  100 
 
 		 423 aa  859    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.79 
 
 		 426 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.49 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  32.63 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  31.47 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  32.22 
 
 		 427 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  29.19 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  35.37 
 
 		 147 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 339 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.69 
 
 		 148 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  35.26 
 
 		 234 aa  87  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  36.08 
 
 		 246 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  35.14 
 
 		 150 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.33 
 
 		 149 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  36.42 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  35.44 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  36.13 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  34.69 
 
 		 150 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  35.1 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 149 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  34 
 
 		 149 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  33.77 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  37.66 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.23 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  36.84 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  33.1 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  31.34 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  26.6 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  34.64 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  34.03 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 		 150 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 		 150 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  30.86 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  33.11 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  25.34 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32.21 
 
 		 152 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.21 
 
 		 153 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  33.73 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  24.46 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  30.67 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.19 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.15 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.63 
 
 		 155 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  33.56 
 
 		 226 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.05 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.66 
 
 		 147 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  23.33 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 154 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 150 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 150 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  26.28 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.76 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.76 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.84 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  27.91 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  31.08 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  30.12 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.18 
 
 		 160 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  31.51 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  26.32 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 152 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 196 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 155 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  26.51 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  34.06 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  26.45 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  21.89 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  30.32 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  23.81 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  36.05 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  22.5 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.67 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  32.45 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  32.31 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  31.1 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  22.92 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.68 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  28.22 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  24.68 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.07 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25.81 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.22 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>