106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2322 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  78.5 
 
 
413 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  796    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  33.49 
 
 
409 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 
428 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 
427 aa  159  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  33.1 
 
 
436 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  32.08 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.23 
 
 
426 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.24 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
431 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.36 
 
 
417 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  41.58 
 
 
113 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  41.49 
 
 
126 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  41.12 
 
 
115 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  39 
 
 
116 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  41.24 
 
 
110 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  38.46 
 
 
112 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  39.18 
 
 
110 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  39.22 
 
 
114 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  40.4 
 
 
125 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  40.4 
 
 
125 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  40 
 
 
131 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  38.14 
 
 
112 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  37 
 
 
114 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  38.14 
 
 
119 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  35.14 
 
 
130 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  38.3 
 
 
109 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  35.92 
 
 
118 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  37.11 
 
 
114 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  35.48 
 
 
102 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.84 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  35.05 
 
 
115 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  39.36 
 
 
138 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  38 
 
 
114 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  35.92 
 
 
115 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
115 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  29.9 
 
 
112 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  28.87 
 
 
108 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  35.35 
 
 
116 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  30.93 
 
 
101 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  34.07 
 
 
114 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  35.48 
 
 
270 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  33.01 
 
 
114 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  28.87 
 
 
110 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  30.43 
 
 
113 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  34.07 
 
 
113 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  34.41 
 
 
107 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  31.73 
 
 
111 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  31.63 
 
 
114 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  28 
 
 
111 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  26.8 
 
 
107 aa  59.7  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  34.74 
 
 
119 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  29.7 
 
 
123 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  28 
 
 
102 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  34.74 
 
 
119 aa  58.9  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  31.87 
 
 
105 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  28 
 
 
102 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  30.61 
 
 
108 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  29 
 
 
114 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  33.65 
 
 
341 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  26.73 
 
 
112 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  32.69 
 
 
116 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  30.85 
 
 
108 aa  53.9  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  32.65 
 
 
109 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  28.72 
 
 
101 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  26.47 
 
 
112 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  31.63 
 
 
109 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  35.44 
 
 
103 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  31.31 
 
 
109 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  27.27 
 
 
110 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  19.67 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  26.6 
 
 
113 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  26.72 
 
 
357 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 
148 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  34.29 
 
 
103 aa  47.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
105 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  24.78 
 
 
114 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  20.54 
 
 
411 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13088  hypothetical protein  31.58 
 
 
369 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.193981  normal  0.734737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
209 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 
279 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  27.59 
 
 
118 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  30.21 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  28.67 
 
 
150 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
224 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  22.86 
 
 
269 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  18.86 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0469  CBS domain containing protein  27.4 
 
 
138 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  18.42 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.87 
 
 
379 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 
196 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  33.33 
 
 
152 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  31.69 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
143 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>