115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0396 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  233  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  60.95 
 
 
114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  57.26 
 
 
130 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  50.48 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  53.85 
 
 
113 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  46.67 
 
 
110 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  53.06 
 
 
114 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  50 
 
 
110 aa  100  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  49.52 
 
 
114 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  49.51 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  47.06 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  48.18 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  51.02 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  43.14 
 
 
119 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  47.52 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  46.09 
 
 
116 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  45.54 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  44.12 
 
 
426 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  48.98 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  48.98 
 
 
125 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  42.86 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
428 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  43.14 
 
 
427 aa  87  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  45 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  44.09 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  42.72 
 
 
270 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  41.76 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  39.45 
 
 
112 aa  83.6  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  40.62 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  43.18 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  43.69 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  38.79 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  38.79 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  38.38 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  42.17 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  39.8 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  44.44 
 
 
417 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  41.75 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  39.18 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  37.5 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  37.84 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  42.55 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  39.08 
 
 
111 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  44.12 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  40.2 
 
 
107 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  43.02 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  36.63 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  35.35 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  34.74 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  45.57 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  35.35 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  34.31 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  35.85 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  35.92 
 
 
414 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  35.58 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  34.34 
 
 
433 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  36.27 
 
 
427 aa  67  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  33.98 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  41.9 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  32.65 
 
 
102 aa  60.1  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  35.05 
 
 
409 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  33.02 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  34.31 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  34.31 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  31.68 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  34.78 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  35.05 
 
 
341 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  31.52 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  29.33 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  35 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  31.51 
 
 
118 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  32.61 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  32.61 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  33.7 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  32.61 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  31.37 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  27.55 
 
 
109 aa  50.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  35.16 
 
 
348 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  26.27 
 
 
431 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  30.43 
 
 
273 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  27.17 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  36.23 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  36.23 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  32 
 
 
357 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  30.39 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2544  hypothetical protein  38.89 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  32.35 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3453  hypothetical protein  47.06 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.933518  normal  0.0779041 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  31.18 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  31.37 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  24.73 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>