106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2298 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  61.68 
 
 
116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2292  hypothetical protein  46.85 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  47.62 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  43.69 
 
 
110 aa  91.3  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  45.05 
 
 
116 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  44.23 
 
 
110 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  46.6 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  45.79 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  44.23 
 
 
114 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  42.31 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  41.75 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  43.69 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  41.67 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  44.44 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  41.67 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  40.38 
 
 
112 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  47.42 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  45.63 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  46.15 
 
 
114 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  43.4 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  41.9 
 
 
270 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  43.4 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  40.78 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  42.99 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  42.99 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  44.76 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  41 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  41 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  40.37 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  38.68 
 
 
114 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  40.38 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  36.89 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  40.59 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  42.16 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  37.11 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  36.25 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  37.86 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  37.5 
 
 
426 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  35.78 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  41.44 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  35.24 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  41.56 
 
 
417 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  36.73 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  37.5 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  34.34 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  34 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  38.75 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  32.41 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  35.44 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  38.96 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  35.8 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  41.25 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  37.5 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  33.94 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  29.52 
 
 
111 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  33.94 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 
431 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
427 aa  53.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  33.94 
 
 
109 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  31.48 
 
 
433 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  32.14 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  32.14 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  33.01 
 
 
428 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  31.48 
 
 
436 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  28.3 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  28.85 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  28.28 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  33.33 
 
 
413 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  32.08 
 
 
273 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.01 
 
 
427 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  30.95 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  31.71 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  30.95 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  30.95 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  30.95 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  29.76 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13088  hypothetical protein  33.33 
 
 
369 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.193981  normal  0.734737 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  30.56 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  31.03 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  28.24 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  35.62 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  31.48 
 
 
414 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  27.06 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  27.06 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1035  hypothetical protein  31.46 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  31.82 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  36.67 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  36.67 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  29 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2544  hypothetical protein  40.51 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  32.67 
 
 
348 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4483  hypothetical protein  25.26 
 
 
99 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  32.91 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>