43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2292 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2292  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  228  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  46.85 
 
 
113 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  37.27 
 
 
116 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  34.58 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  37 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  35.64 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  34.34 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  35.71 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  35.35 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  35.29 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  33 
 
 
114 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34 
 
 
270 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  34.58 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  34.58 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  30.3 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  33.01 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  32.32 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  29.91 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  33.67 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  32.04 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  33.65 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  28.41 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  26.8 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.29 
 
 
426 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  34.62 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  27.72 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  31.73 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  25.74 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  26.42 
 
 
118 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.84 
 
 
417 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  27.62 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  29.13 
 
 
125 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  29.13 
 
 
125 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  32.05 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  30.48 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  25 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  28.85 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  31.08 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  29.25 
 
 
128 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  24.04 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>