95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3966 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  100 
 
 
130 aa  261  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  61.82 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  57.14 
 
 
114 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  53.21 
 
 
128 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  55.45 
 
 
110 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  57.26 
 
 
115 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  54.55 
 
 
110 aa  123  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  54.55 
 
 
110 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  54.21 
 
 
113 aa  118  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  50.91 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  54.46 
 
 
116 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  51.38 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  50.47 
 
 
114 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  46.55 
 
 
116 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  44.72 
 
 
426 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  43.7 
 
 
131 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  47.66 
 
 
114 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  42.72 
 
 
123 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  48.04 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  46.73 
 
 
126 aa  97.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  41.82 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  40 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  41.07 
 
 
427 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  40.18 
 
 
428 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  42.99 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  38.18 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  43.88 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  43.88 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  44.55 
 
 
270 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  46.88 
 
 
417 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  39.45 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  42.59 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  42.59 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  35.51 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  45.78 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  34 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  44.58 
 
 
112 aa  84  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  38.94 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  39.25 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  39.77 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  40.7 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  40.19 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  43.37 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  36.73 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  33.64 
 
 
436 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  37.74 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  35.14 
 
 
414 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  39.56 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  39.81 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  32.71 
 
 
433 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  32.43 
 
 
413 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  38.3 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  38.32 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  37.37 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  40.23 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  38.61 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  34.58 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  33.01 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  37.37 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  37.62 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  37.21 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  28.12 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
431 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  34.78 
 
 
108 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  30.85 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  35.24 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  30.84 
 
 
341 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  35.06 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  31.11 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  31.11 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  27.55 
 
 
409 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2292  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  33.87 
 
 
357 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  27.73 
 
 
348 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  29.13 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3453  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.933518  normal  0.0779041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  26.88 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0303  hypothetical protein  32.22 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4483  hypothetical protein  30.86 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  27.63 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  31.75 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2600  protein of unknown function DUF190  39.66 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0518  hypothetical protein  30 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  23.42 
 
 
423 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  30 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  30 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  26.25 
 
 
118 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>