70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1487 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  57.14 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  47.62 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  46.6 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  49.51 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  51.92 
 
 		 107 aa  106  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  41.35 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  39.81 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  44.66 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  44.66 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  41.58 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  52 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  52 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  35.92 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  37 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  30.84 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  32.04 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  31.07 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  31.07 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  30.1 
 
 		 273 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  31 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  30.48 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  29.63 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  31.37 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  28.71 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  34.31 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  36.9 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  31.76 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  32.53 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  30.95 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  30.12 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  37.84 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  32.14 
 
 		 426 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  35.8 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  33.73 
 
 		 433 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  26.19 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  30.86 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  33.73 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  30.86 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  30.12 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  34.67 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  32.89 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  32 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  30.67 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  35.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  28.21 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  32.76 
 
 		 417 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  26.67 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  27.71 
 
 		 116 aa  40.8  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  29.63 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  30 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  32.88 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  27.16 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  28.21 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  30.1 
 
 		 112 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>