57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  223  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  55.66 
 
 
120 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  56.31 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  51.46 
 
 
108 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  48.6 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  47.62 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  47.62 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  47.57 
 
 
105 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  46.3 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  46.6 
 
 
103 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  45.71 
 
 
122 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  37.14 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  39.81 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  37.86 
 
 
105 aa  77  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  47.44 
 
 
83 aa  77  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  36.89 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  40.62 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  35.92 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  38.54 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  38.54 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  38.54 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  35.92 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  38.54 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  35.92 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  37.5 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  33.98 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  33.01 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  33.01 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  32.43 
 
 
426 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  34.25 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  33.85 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  34.25 
 
 
110 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
110 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  33.85 
 
 
102 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  34.18 
 
 
436 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  34.62 
 
 
433 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  31.51 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  24.71 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  33.82 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  32.18 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  26.76 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  31.08 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  36.92 
 
 
417 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  40.98 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  33.75 
 
 
431 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  29.29 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  26.58 
 
 
114 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  28.57 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>