52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1947 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  52.88 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  56.31 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  56.31 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  44.23 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  43.27 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  43.27 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  40.95 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  42.5 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  42.5 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  34.91 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  34.31 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  35.64 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  31.73 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  32.08 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  32.08 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  34.65 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  31.13 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  32.08 
 
 		 273 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  32.67 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  32.67 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  30.19 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  30.19 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  30.19 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  30.19 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  33.01 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  27.08 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  31.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  27 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  25.49 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  28.95 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  35.09 
 
 		 417 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  27.55 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  31.43 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 		 431 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  30.61 
 
 		 110 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  30.43 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  29.55 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>