48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2525 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  220  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  56.31 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  49.52 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  47.57 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  42.31 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  40.78 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  35.58 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  36.54 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  38.61 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  31.73 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  39.18 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  35.24 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  37.11 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  37.11 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  37.11 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  35.24 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  35.24 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  37.11 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  37.11 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  36.08 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  29.25 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  31.65 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  31.65 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  31.07 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  25.49 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  29.41 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  30.12 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  34.48 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  30.68 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  30.38 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  28.4 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  30.12 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  29.7 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  29.41 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  29.63 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  31.03 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  28.4 
 
 		 270 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>