86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3084 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  99.15 
 
 
118 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  98.31 
 
 
273 aa  238  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  95.65 
 
 
118 aa  226  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  97.17 
 
 
118 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  97.17 
 
 
118 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  97.17 
 
 
118 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  97.17 
 
 
118 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  83.9 
 
 
116 aa  203  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  83.9 
 
 
116 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  83.9 
 
 
116 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  83.9 
 
 
116 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  82.2 
 
 
116 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  82.2 
 
 
116 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  85.05 
 
 
118 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  43.14 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  34.45 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  35.92 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  31.13 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  31.07 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  31.07 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  34.52 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  37.5 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  33.01 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  34.29 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
428 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  30 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  31.96 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  34.57 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  29.07 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  32.05 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  36.76 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  32.32 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  36.76 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  34.21 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  32.1 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  33.03 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  27.71 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  30.86 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  30.39 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  27.5 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  31.08 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  29.33 
 
 
115 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  29.63 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  35.62 
 
 
417 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  30.12 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  31.51 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  31.43 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  32.43 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 
427 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  31.08 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  31.51 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  29.27 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  31.43 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  34.25 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  30.95 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  27.38 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  28.28 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  28.87 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  29.63 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  34.91 
 
 
107 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  29.87 
 
 
270 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  30.12 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0511  hypothetical protein  32.56 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  25.61 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  28.16 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  34.43 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  32.1 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  40.82 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  28.16 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  26.04 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  26.32 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  26.32 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  29.31 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2544  hypothetical protein  29.82 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  31.17 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  25.23 
 
 
111 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  29.67 
 
 
436 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>