71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2544 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2544  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  36.04 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  34.91 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  37.74 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  40.38 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  41.05 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  38.53 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  34.58 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  40.21 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  35.45 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  43.18 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  42.16 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  38.1 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  42.11 
 
 
114 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  39.77 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  37.8 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
428 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  37.11 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  37.8 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  33.71 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  35.79 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  37.04 
 
 
417 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  42.7 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  35.37 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  30.7 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 
427 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  35.96 
 
 
114 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  32.05 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  34.58 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  31.73 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  35.35 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  34.41 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  35.78 
 
 
427 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  31.18 
 
 
426 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  35.8 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  33.72 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  30.61 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  32.99 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  34.57 
 
 
116 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  32.41 
 
 
270 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  25 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  31.07 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  36.51 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  34.23 
 
 
413 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  25 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  36.11 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  30.84 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  25 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  32.2 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  32.95 
 
 
409 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  26.51 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  34.31 
 
 
414 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  28.38 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  30 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 
431 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  34.48 
 
 
105 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  29.89 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  32.53 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  35.44 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  29.89 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  32.53 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  34.41 
 
 
436 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>