88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0201 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  100 
 
 
113 aa  228  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  58.18 
 
 
115 aa  131  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  48.57 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  44.55 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  53.41 
 
 
113 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  47.62 
 
 
111 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  49.09 
 
 
112 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  44.32 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  43.18 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  44.83 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  49.4 
 
 
118 aa  90.5  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  44.83 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  42.53 
 
 
417 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  45.45 
 
 
116 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  40.91 
 
 
110 aa  87  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  44.09 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  43.02 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  39.36 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  42.17 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  40.7 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  41.18 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  38.55 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  44.74 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  41.86 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  40.23 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  40.23 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  40 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  39.29 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  38.82 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  39.53 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  41.56 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  38.71 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  39.29 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  40.59 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  43.02 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  43.02 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  34.07 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  39.29 
 
 
108 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  38.82 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  38.55 
 
 
426 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  36.14 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  40.91 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  32.26 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  38.55 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  36.14 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  34.88 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  42.47 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  37.35 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  38.82 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  36.47 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  40.45 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 
427 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  38.2 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  34.09 
 
 
102 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  34.07 
 
 
414 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  34.48 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
428 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  37.66 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  39.33 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  39.06 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  34.83 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.49 
 
 
433 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  30.23 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0584  protein of unknown function DUF190  41.67 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.483034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  31.94 
 
 
436 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  30.77 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2292  hypothetical protein  28.41 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  29.03 
 
 
427 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  31.65 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  28.41 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  28.57 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  28.57 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  29.27 
 
 
105 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  38.64 
 
 
103 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  32.65 
 
 
103 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  25.93 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0303  hypothetical protein  36.99 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  24.39 
 
 
431 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  28.38 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3453  hypothetical protein  36.73 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.933518  normal  0.0779041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1035  hypothetical protein  27.5 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0511  hypothetical protein  26.67 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  24.36 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4483  hypothetical protein  25.93 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>