46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0303 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0303  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  41.24 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  41.24 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  37.62 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2600  protein of unknown function DUF190  32.65 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1035  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  32.98 
 
 
110 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  30.77 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  33.02 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  27.03 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  27.72 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  31.25 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1037  hypothetical protein  27.88 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  29.67 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  29 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  29.47 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  30.69 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34.07 
 
 
270 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  29.79 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  32.58 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  34.04 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  31.25 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  36.99 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  32.22 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  32 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0930  hypothetical protein  26.92 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.18 
 
 
428 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  32 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  33.71 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  35 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  28.87 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  36.99 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  29.03 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  33.87 
 
 
427 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  29.03 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  31.43 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  31.82 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  25.53 
 
 
102 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  27.17 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  36.36 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  30.99 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.96 
 
 
417 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>