76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1930 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1035  hypothetical protein  46.46 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2600  protein of unknown function DUF190  44.33 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  37.76 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1037  hypothetical protein  37.11 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0930  hypothetical protein  37.11 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  40.21 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  49.28 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 		 428 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  61.54 
 
 		 427 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0303  hypothetical protein  37.62 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  40.51 
 
 		 433 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  39.24 
 
 		 436 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  40.74 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  45 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  36.27 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  50.98 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  36.08 
 
 		 426 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  38.75 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  34.02 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  34.12 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  51.85 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  51.85 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  39.29 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  37.8 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  36.25 
 
 		 427 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  32 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  29.25 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  35.53 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  47.06 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  35.44 
 
 		 414 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  36.25 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  43.14 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  34.83 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  30.59 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  34.18 
 
 		 431 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  29.76 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  35.56 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  38.96 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  38.96 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  38.18 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  37.33 
 
 		 417 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  32.22 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  28.26 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  31.46 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  43.64 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  31.11 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  45.1 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  43.4 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  45.1 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  43.64 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  47.83 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  38.64 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  33.77 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  36.36 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  31.31 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  32.94 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  35.62 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  29.63 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  32.63 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  44.23 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  35.42 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  35.29 
 
 		 110 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  35.19 
 
 		 270 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>