61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2600 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2600  protein of unknown function DUF190  100 
 
 
99 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1035  hypothetical protein  52.63 
 
 
104 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  45 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  44.33 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1037  hypothetical protein  41.67 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0930  hypothetical protein  39.58 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0303  hypothetical protein  32.65 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.935135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  58.33 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  37.97 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  35 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  33 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  34.44 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  37.18 
 
 
108 aa  50.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  37.8 
 
 
426 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  34.18 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  34.18 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  31.11 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  50 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  39.51 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  37.66 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  50 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  30.23 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  43.33 
 
 
131 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  46.55 
 
 
113 aa  48.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  39.71 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  37.68 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  36.36 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  32.26 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  34.48 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  43.1 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  32.61 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  37.93 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
428 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  32.14 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  31.87 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  41.38 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  31.65 
 
 
417 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  28.41 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
431 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  30.21 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  30.11 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  37.93 
 
 
427 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  38.75 
 
 
413 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  37.29 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  30.86 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  28.36 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  30.11 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  39.66 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  26.97 
 
 
114 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  30.39 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  32.18 
 
 
112 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  36.67 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  43.75 
 
 
111 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  32.1 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  29.35 
 
 
109 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
433 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  35.48 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  29.27 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  43.14 
 
 
114 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>