66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0456 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  100 
 
 
112 aa  215  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  35.85 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  37.21 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  40.7 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  39.18 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  34.07 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  34.74 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  34.18 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  38.37 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  28.92 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  29.21 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  28.05 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  33.72 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  34.88 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  37.97 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  36.49 
 
 
111 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  35.23 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  32.05 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  32.22 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  30.3 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  34.62 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0584  protein of unknown function DUF190  25.97 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.483034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  34.94 
 
 
125 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  34.94 
 
 
125 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  27.84 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  34.15 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  29.07 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  28.26 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  28.26 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  29.87 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  28.26 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  30.12 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  28.26 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  27.17 
 
 
273 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  29.49 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  30.61 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  27.84 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  27.55 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  29.89 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  27.55 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  31.71 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  27.66 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  28.38 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  28.4 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  32.93 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  26.8 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  28.21 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2600  protein of unknown function DUF190  32.18 
 
 
99 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  27.38 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  32.05 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  25 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  29.29 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  30.1 
 
 
107 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  25.47 
 
 
127 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  30.1 
 
 
107 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>