109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4548 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  228  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  69.91 
 
 
114 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  67.89 
 
 
116 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  62.96 
 
 
110 aa  137  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  62.26 
 
 
114 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  62.73 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0819  hypothetical protein  63.96 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622964  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0769  hypothetical protein  63.96 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  63.89 
 
 
113 aa  133  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  61.9 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  55.14 
 
 
270 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  57.01 
 
 
110 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  58.82 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  50.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  55.14 
 
 
138 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  55.88 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  55.88 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  55.88 
 
 
125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  48.62 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  52.25 
 
 
114 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  52.94 
 
 
114 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  54.55 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  51.38 
 
 
131 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  52.83 
 
 
114 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  50.47 
 
 
130 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  50.89 
 
 
115 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  48.6 
 
 
128 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  51.4 
 
 
426 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  49.52 
 
 
115 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2397  protein of unknown function DUF190  49.02 
 
 
111 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  48.6 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2801  protein of unknown function DUF190  48.08 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.628969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2039  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  97.8  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.364154  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  45.13 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2289  hypothetical protein  44.86 
 
 
116 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  44.12 
 
 
417 aa  90.9  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  41.28 
 
 
114 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0201  protein of unknown function DUF190  44.83 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.284086  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2558  hypothetical protein  51.02 
 
 
112 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0902  hypothetical protein  44.33 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2494  hypothetical protein  42.59 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0924  hypothetical protein  43.3 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  45.1 
 
 
115 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  47.25 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0609  hypothetical protein  41.35 
 
 
115 aa  84  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0181  hypothetical protein  44.44 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1418  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0187678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  41.28 
 
 
427 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  44 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  37.61 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1299  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.380913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  35 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  39.25 
 
 
413 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2298  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2580  hypothetical protein  38.83 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.871261  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0017  hypothetical protein  37.25 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2545  hypothetical protein  37.86 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  38 
 
 
414 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  33.67 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0589  hypothetical protein  34 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2508  hypothetical protein  37 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.93047e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3453  hypothetical protein  56.14 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.933518  normal  0.0779041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
433 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  33.33 
 
 
436 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0314  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3598  hypothetical protein  32 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0523  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.347437  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2292  hypothetical protein  35.35 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.915539  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
431 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1396  hypothetical protein  36.36 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.256096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0334  hypothetical protein  33.94 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  32.99 
 
 
409 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4483  hypothetical protein  30.43 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.63 
 
 
427 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  33.72 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7203  protein of unknown function DUF190  32.61 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1840  hypothetical protein  31.63 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717731  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0585  protein of unknown function DUF190  30 
 
 
103 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.618198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  32.86 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  32.86 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  32.86 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  32.86 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3112  hypothetical protein  32.86 
 
 
273 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3029  hypothetical protein  31.43 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3084  hypothetical protein  31.43 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  30.38 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  30.38 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  30.38 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  29.11 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2542  protein of unknown function DUF190  31.65 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2927  hypothetical protein  31.65 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1930  hypothetical protein  33.77 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  26.19 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  28.85 
 
 
341 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  26.19 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>