47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1947 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1947  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4409  hypothetical protein  62.06 
 
 
348 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13088  hypothetical protein  51.84 
 
 
369 aa  325  6e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.193981  normal  0.734737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1725  hypothetical protein  46.63 
 
 
339 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1704  hypothetical protein  46.63 
 
 
339 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.220513  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1772  hypothetical protein  46.63 
 
 
339 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00902613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4412  protein of unknown function DUF190  41.59 
 
 
357 aa  242  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0907  protein of unknown function DUF190  36.27 
 
 
114 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.59856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2956  hypothetical protein  40.78 
 
 
128 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1022  protein of unknown function DUF190  33.68 
 
 
112 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  31.73 
 
 
114 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2103  hypothetical protein  39.8 
 
 
116 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2472  hypothetical protein  30.77 
 
 
110 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  35.58 
 
 
115 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  29.91 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1536  hypothetical protein  35.24 
 
 
114 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150946  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  32.65 
 
 
125 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0955  protein of unknown function DUF190  34.69 
 
 
112 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  32.65 
 
 
125 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0982  hypothetical protein  31.37 
 
 
112 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2769  protein of unknown function DUF190  32.69 
 
 
110 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  31.87 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3017  hypothetical protein  28.16 
 
 
114 aa  57  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0306323  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3966  protein of unknown function DUF190  30.84 
 
 
130 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0280785  normal  0.332101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0610  hypothetical protein  40.43 
 
 
138 aa  56.2  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.309458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2284  hypothetical protein  32.69 
 
 
113 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0310791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2322  hypothetical protein  33.65 
 
 
414 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2688  hypothetical protein  31.31 
 
 
116 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0462  protein of unknown function DUF190  34.26 
 
 
131 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2947  hypothetical protein  32.63 
 
 
114 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0526  hypothetical protein  35.11 
 
 
123 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245852  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1697  hypothetical protein  32.69 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  29.59 
 
 
112 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  29.7 
 
 
119 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3713  hypothetical protein  30.48 
 
 
126 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2323  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.329847  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2999  protein of unknown function DUF190  28.85 
 
 
110 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0396  hypothetical protein  35.05 
 
 
115 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5462  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.516775  normal  0.0516073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0929  hypothetical protein  29.29 
 
 
108 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.846171  hitchhiker  0.00345393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4548  hypothetical protein  28.85 
 
 
114 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1100  hypothetical protein  24 
 
 
107 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0192  protein of unknown function DUF190  27.91 
 
 
115 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  30 
 
 
428 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0521  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1282  hypothetical protein  24.21 
 
 
113 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0271476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  29.81 
 
 
118 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>